针对关税税率下调，进出口应税货物升幅有限等因素给海关税收带来的影响，上海海关强化综合治税，加强税收分析预测，加大商品归类、价格审核、报关规范以及企业稽查力度，提高反避税、反瞒骗能力，通过整体联动，综合治税，形成严密的防控体系。今年第一季度，共征税入库253亿余元人民币，每个工作日平均征税4.3亿元人民币。
该关通过对主要税源商品、涉及反倾销税及保证金的商品，以及原产地等要素进行风险分析，密切监控，防止税源流失。规范商品归类，对归类不一致的商品和企业加强核查。一季度，该关归类补税共计2287万元人民币，同比增长12%。与此同时，该关还通过科技手段提高归类准确率，一季度，该关化验中心共分析监测样品1164宗，涉及货值2亿多美元，经鉴定涉嫌伪报、确定品名或调整税号的共451宗。
加大反价格瞒骗工作力度，建立价格监控体系，通过商品调研与行业调查相结合，及时掌握市场价格波动情况，强化对重点商品的估价管理，加大对高风险商品的价格核查力度。一季度，该关共对4686批进口货物估价补税6924万元人民币，补税金额同比增长22.2%。其中，3月份共对1745批进口货物估价补税2880万元人民币。
加强对加工贸易的监管，对重点敏感商品和加工周期长的商品进行重点核查，加强对加工企业的稽查并规范核销手续。今年一季度，该关共对171家企业实施稽查，补税1481万元人民币，同比增长40%。罚没收入192万元人民币，同比增长11倍。
海关缉私部门有针对性地开展专项行动，打击贸易性涉税走私违法行为。一季度共立案635起，案值3.32亿元人民币，涉嫌偷逃税款1791万元人民币；罚没入库2916万元人民币。
除此之外，该关还继续加大与企业、银行之间的合作力度，大力推行税费网上支付和EDI电子支付。目前，已有999家企业加入网上支付行列。
